~スクラッチディスクが、高速化を加速する~   Gaussian向けお勧め構成

科学技術計算では、高い精度で計算を行おうとすると非常に大容量のメインメモリを必要とします。Gaussian などのアプリケーションは、以前から、メモリに比べて大容量な HDD などの記憶媒体を利用し、仮想的にメモリと設定することにより、より安価に大容量メモリを実現してきました。この大容量メモリを有効に使って計算を行うことによって、高度な計算環境実現しています。

しかし、HDD などのストレージのアクセス速度はメモリに対するそれよりも数千~数百万倍も遅いため、速度の影響を受けてしまい、そこが計算のボトルネックになっているのが実情です。よって、スクラッチディスクの高速化を実現することにより、計算時間を短縮することが可能です。

計算を行う過程で生成される中間データをファイルとしてディスクに一時保存するアプリケーションは数多くあります。このデータ(スクラッチデータ)は往々にして大量であり、頻繁にアクセスされることが多いものです。これを超高速なストレージに設定するとアプリケーションの実行時間短縮に大きく貢献いたします。Gaussian、Wien2K のようなスクラッチを多用するアプリでは特に効果を発揮します。SSD、SSD+RAID0、NVMe 等の高速ストレージを有効に活用することにより、量子化学計算、電子構造計算など計算時間に大きな時間を要すものが、コストを最小限に抑えつつ高速化を図れます。

製品特徴

「CERVO Grasta Type-ES4 for Gausssian09」は、OS 非搭載モデルです。オプションで、Windows® 10/8.1/7 のご選択はもちろんのこと、RHEL や CentOS 6x/7x、Ubuntu16.xx LTS などの Linux のインストール代行も行っております。

Linux OS は、ディストリビューションやバージョンにより、最新のハードウェアへの対応が異なるため、ドライバーの対応などのハードウェアの動作確認が必要不可欠になります。「CERVO Grasta シリーズ」では、安定してご利用いただけるように、全機種動作確認済みです。また、開発環境のインストールを行った場合は、サンプルのビルド、実効により動作確認を行っております。

通常のハードウェア・ソフトウェア検証に加え、Linux 専用の動作確認項目でチェックしております。

1)プロセッサー・コアの認識、命令のサポート確認

2)大容量メモリーの認識、動作確認

3)USB 3.0 の動作確認

4)LAN ドライバーの確認、ネットワークテスト

5)RAID ドライバーの確認、管理ユーティリティーによる動作確認

6)グラフィックドライバーの動作、インストール

ご利用予定のアプリケーションがある場合、アプリケーションのサポートしているディストリビューション、バージョンをご選択ください。また、サポート期間や開発環境・ライブラリー等のバージョン等もご確認ください。

静音仕様ミドル・タワー型ケース

[2基] インテル ® Xeon® E5 2600 V4 シリーズ プロセッサー (Broadwell-EP)

強力な新しいインテル® Xeon® プロセッサー E5-2600 v4 製品ファミリーは、多様なワークロードを対象とした汎用性を実現します。これらのプロセッサーは、クラウド専用アプリケーションや従来型アプリケーションの違いを超えて、効率性、パフォーマンス、俊敏なサービス配信を実現するソフトウェア・デファインド・インフラストラクチャー上で動作する次世代データセンターを構築する目的で開発されました。これらは、クラウド、HPC、ネットワーク、ストレージ向けのワークロードをサポートします。

14nm プロセス技術を用いて製造されるインテル® Xeon® プロセッサー E5 v4 ファミリーは、ソケット当たり最大 22 コア / 44 スレッドとソケット当たり最大 55 MB の L3 キャッシュによってパフォーマンスが向上し、さらにインテル® トランザクショナル・シンクロナイゼーション・エクステンション (インテル® TSX) によって並行ワークロード性能も向上しています。

キャッシュ・モニタリングとアロケーション機能、コードおよびデータの優先順位付け、メモリー帯域幅モニタリングを提供するインテル® Resource Director Technology (インテル® RDT) によって、共有リソースを効率よく動的に管理し、リソースの利用率を向上します。

暗号化性能の向上により、安全な接続環境で暗号化データをより速く送信でき、さらに最新のセキュリティー・キーが、ネットワーク・アクセスの保護およびプラットフォーム保護の強化を支援します。

Registered-ECC メモリ 64GB (最大 512GB 対応 / DDR4-2400) (基本仕様)

DRAM の製造には、極めて繊細な技術が必要で、稀に品質の安定しない個体が派生する場合があります。メモリモジュール製品における市場不具合は、DRAM に起因することも少なくありませんので、DRAM メーカーの厳しい検査をパスした証である「メーカーロゴの刻印された正規品」のみを採用しています。それにより、優れた性能や耐久性、安定した品質をお約束します。

Registered とは、信号を安定強化させる回路と、クロック信号のタイミングに合わせて出力します。これにより、微妙にずれた信号のタイミングを補正することで、メモリアクセス動作を安定して行えます。

ECC とは、メモリーのエラー訂正を行う機能です。誤った値を検出して訂正します。Non ECC に比べ、より多くの冗長データを必要としますが、データの誤りが発生しても、システムを問題なく稼働させ続けることができます。

インテル® C612 チップセット (高耐久メインボード)

高品位の固体コンデンサやチョークコイルなどを搭載することで、高い耐久性を実現している「Supermicro Computer inc.」製のメインボードを採用しています。

業界をリードする高度なサーバーテクノロジーを提供するプレミアプロバイダーとして、高度な ServerBuilding Block Solutions をデータセンター、クラウドコンピューティング、エンタープライズIT、Hadoop/ビッグデータ、HPC の分野にて全世界で採用され、高い評価を得ています。

サーバーグレードのパーツ採用により実現するサーバークオリティ ハードコアゲーマーに高い信頼性と究極の性能を提供します。






バックパネルの仕様については、基本仕様ページでご確認ください。

80 Plus Gold 認証電源 900W (静音仕様)

コンピューターやサーバーの電源が 20% ~ 100% の負荷環境下において、電源交換効率 80% 以上がスタンダードという基準に対して、80 Plus Platinum は、90% 以上 (20% 負荷時)、92% 以上 (50% 負荷時)、89% 以上 (100% 負荷時) の効率性を発揮する電源ユニットを標準採用しています。

電力変換効率の向上した電源ユニットは、発熱の減少によって冷却ファンの回転数の低下による静音化や電子部品の劣化低減が可能になり、コンピュータの快適性や省電力性の向上と同時に製品寿命も伸びます。

高耐久ストレージ WD Gold 1TB (基本仕様)

Western Digital Technologies 社のデータセンター向け大容量 HDDである Re / Gold シリーズを採用しています。

エンタープライズクラスの耐久性が維持できる本格的なデザインながらも、コスト効率が良く、パフォーマンスに優れ、信頼性が高く、作業負荷に耐えうる能力を備えています。

200 万時間以上の MTBF を実現したこの高性能ドライブには、最も要求の厳しいストレージ環境で、24 時間 365 日稼働できる最高の信頼性が備わっています。

OpenGL 4.4 対応 NVIDIA® Quadro® K420 DDR3-2GB (基本仕様)

NVIDIA® Quadro® K420 は 192 基の CUDA コアを持つ GPU を搭載し、素晴らしい 3D アプリケーションパフォーマンスを提供します。

最新の OpenGL 4.4 をサポートし、これから CAD や3DCG を始める方やライトユーザー、そして医療向けアプリケーションユーザーにも最適なパフォーマンスを提供するエントリークラスのプロフェッショナルグラフィックスボードです。