広島市立大学 情報科学部 

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使用用途

 ヘムタンパク質の構造と機能の関係を深層学習で調べること、および、分子動力学シミュレーションによりタンパク質のダイナミクスを調べることを目的としたワークステーションです。TensorFlowやPyTorchを使った自作プログラムと、AMBERやGROMACSを使用します。計算負荷の高い処理を行うため、高性能なハードウエアが必要で、同時に、それぞれのツールが異なるリソースに依存するため、バランスの取れら構成が理想的です。  深層学習にはNVIDA製GPUが必須で、特にAMBERやGROMACSもGPU対応が進んでいることも踏まえ、RTX4080Superを採用しました。CPUは学習時の前処理やデータローディングングを考慮し、20コア/28スレッドのCorei7-14700、メモリはUbuntuの安定動作と大規模データの前処理のため128GB、ストレージは、システム用に高速NVMe、データ用に大容量10TBのHDDとしました。

参考価格

853800

ヘムタンパク質の構造と機能の関係の深層学習用ワークステーション

基本システムUbuntu 22.04 LTS インストール代行
開発環境DockerDesktop(Tensor Flow 2.x/Pytorch 2.x/Chainer 7.x)※Ubuntu 22.04 LTS の場合のみ選択可
リカバリー・ディスクリカバリ・ディスク作成(USB メモリ) ※ RAID 構成ストレージでは選択不可
筐体ミドル・タワー型(ブラック)筐体 (W)220mm x (D)493mm x (H)506mm
筐体ファン[標準]前面:120mm fan x 2 (1200 RPM ) 背面:120mm fan x 1 (1200 RPM )
電源ケーブル100V 用電源ケーブル
チップセットインテル Q670 チップセット(産業用マザーボード)
プロセッサーCore i7-14700 (20コア/28スレッド/2.1GHz/tb5.4GHz/33M/Intel UHD Graphics 770/TDP65W(Max219W)/DDR4-3200/DDR5-5600)
プロセッサー・ファンサイドフローCPUクーラー(120mmFAN、6mmヒートパイプ×6) TDP=250W 最大35.2dBA
メモリー128GB(32GB x4)DDR4-3200(PC4-25600)
ストレージ(標準)4TB M.2 NVMe SSD R:7300MB/s W:6600MB/s
ストレージ(増設)10TB (7200rpm, 256MB, 6Gb/s SATA)
光学ドライブDVD スーパーマルチ(ブラック)
グラフィック【1GPU】NVIDIA® GeForce RTX™ 4080 Super 16GB-GDDR6X(DisplayPort x3/HDMI x1)PCIe 4.0(x16)10,240 コア ※ 本パーツは 1 年保証になります。
サウンド[オンボード] 7.1ch HD オーディオ(前面:スピーカ/マイクロフォン 背面:スピーカ/サウンド入力/マイクロフォン)
ネットワーク(有線)[オンボード] 2.5 ギガビット・イーサーネット:2 ポート(vPRO 対応 x1)
シリアル・ポートRS232/422/485:2 ポート ※ 内部ヘッダーの利用で、最大 4 ポートの RS-232C を追加で利用可能。
エージング[無料] 12時間エージング
I/OUSBUSB3.2 Gen2x2 Type-C:1 ポート(背面)| USB3.2 Gen2 Type-A:5 ポート(背面)| USB3.0 Type-A:2 ポート(上面)
サウンド7.1 チャンネル HD オーディオ(前面:スピーカ/マイクロフォン | 背面:スピーカ/サウンド入力/マイクロフォン)
シリアルRS232/422/485:2 ポート
その他RJ-45(2.5 ギガビット):2 ポート
拡張スロットPCI Express 4.0(x16):2 スロット(dual at x8(PCIE1)/ x8(PCIE3))
PCI Express 4.0(x4):2 スロット
PCI Express 3.0(x4):1 スロット
PCI:2 スロット

※ M.2 ソケットまたは PCI Express スロットの使用状況に応じて、動作速度の低下や排他仕様となる場合があります。
※ PCI Express スロット形状と動作速度が異なる場合があります。
ストレージM.2 PCI Express 4.0(x4):1 ソケット(M Key | up to 25110)

※ M.2 ソケットまたは PCI Express スロットの使用状況に応じて、動作速度の低下や排他仕様となる場合があります。
メモリスロット4 スロット(2ch)| 最大 128GB(32GB x4)| DDR4-3200 | Unbuffered | Non-ECC
拡張ドライブベイ5.25 インチ・ベイ:2 ポート | 3.5/2.5 インチ・ベイ:2 ポート(シャドウ) | 2.5 インチ・ベイ:2 ポート(シャドウ)
キーボード有線日本語キーボード(テンキー付/USB接続)+ 有線マウス(USB接続)セット品
マウスキーボートとのセット品
電源ユニット1200W 80 Plus Platinum 認証(フルモジュラー/ATX3.0 準拠/PCIe 5.0)
外形寸法(約)約(W)220 x(D)493 x(H)506 mm ※ 突起部は除く
保証[標準] 1年間センドバック方式ハードウェア保証  保証コード:YS051124-14